Sait Halim Paşa Yalısı ‘nın tarihte bilinen ilk sahibi Düzoğulları ailesidir. Sait Halim Paşa Yalısı, 1876 senesinde Prens Abdülhalim Paşa’nın mülkiyetine geçmiştir. Sait Halim Paşa Yalısı‘ nın harap halde olması ve de istenilen büyüklükte olmaması nedeni ile Çanakkale’li mimar-kalfa Petraki Adamandidis’e bugünkü biçimiyle yeniden yaptırılmak zorunda kalınmıştır.
1974 senesinde tadilattan geçen Sait Halim Paşa Yalısı, asıl büyük renovasyonu 1980-1984 senelerinde, Turizm Bankası tarafından TAÇ (Türkiye Anıt ve Çevre Koruma) Vakfı’na yaptırılarak gerçekleşmiştir. Sait Halim Paşa Yalısı, 1995 senesinde geçirdiği yangın sonrasında “Başbakanlık Resmi Konuk Evi” ismi altında restore edilmiştir. Bu restorasyon 2002 senesinde bitirilmiştir. Sait Halim Paşa Yalısı, yangından önceki haline göre değil de inşa edildiği 1860’lı senelerindeki haline göre restore edilmiş, 2004 yılında Göçtur Turizm A.Ş.’nin işletmesine devredilene kadar da kullanılmamıştır.